Rakitić membuat debut untuk pasukan kebangsaan Croatia pada 8 September 2007 ketika perlawanan kelayakan UEFA Euro 2008 menentang Estonia di Zagreb, Croatia. Beliau menjaringkan gol pertamanya untuk Croatia ketika perlawanan kelayakan seterusnya menentang Andorra, Croatia menang besar 6–0 pada 12 September 2007.

Pada awal Mei 2008, beliau sertai skuad Croatia yang beraksi di Euro 2008, beliau menjadi pemain kedua termuda. Ketika perlawanan suku akhir menentang Turki, selepas Croatia terikat seri 1-1, Rakitic mengambil sepakan penalti tetapi dapat dibaca oleh penjaga gol Turki, Rüştü Reçber. Croatia tewas kepada Turki 3-1 dan Croatia tersingkir daripada kejohanan itu.

Selepas bermain dalam kesemua perlawanan kelayakan Euro 2012, beliau dimasukkan dalam skuad Croatia yang beraksi di Euro 2012. Rakitic bermain dalam ketiga-tiga perlawanan Croatia di Euro 2012 menentang Republik Ireland, Itali dan Sepanyol.

Dalam kempen kelayakan Piala Dunia FIFA 2014 pada 12 Oktober 2012, beliau menjaringkan gol dari sepakan percuma ketika menentang Macedonia untuk membantu Croatia menang 2-1. Rakitić bermain dalam ketiga-tiga perlawanan Croatia di Piala Dunia FIFA 2014 di Brazil. Beliau membuat hantaran kepada gol tunggal Croatia ketika tewas 3-1 kepada Mexico.[15]

Gol antarabangsa